Πώς να βρείτε το λογισμικό ανάλυσης ακολουθιών γονιδίων;

Οι τεχνολογικές εξελίξεις στην επιστήμη έχουν οδηγήσει σε πιο αποτελεσματικό λογισμικό ανάλυσης ακολουθιών γονιδίων. Αυτός ο τύπος λογισμικού χρησιμοποιείται στη βιοπληροφορική και τη μοριακή βιολογία για να βρει ομοιότητες και ομοιότητες στην ευθυγράμμιση της ακολουθίας των γονιδίων, να εντοπίσει γονιδιακές δομές, να αποκαλύψει γενετικούς δείκτες και πολλά άλλα. Το DNA μπορεί να υποβληθεί σε διάφορες μεθόδους βιοπληροφορικής όπως "ευθυγράμμιση αλληλουχίας, βάσεις δεδομένων ακολουθίας και επαναλαμβανόμενες αναζητήσεις ακολουθίας " μέσω της χρήσης ενός προγράμματος υπολογιστή.

Επιλογές λογισμικού ανάλυσης ακολουθίας γονιδίων

Υπάρχουν πολλές επιλογές λογισμικού ανάλυσης ακολουθίας γονιδίων στην αγορά σήμερα. Ακολουθούν συμβουλές για την εύρεση του σωστού προγράμματος ανάλυσης.

1. Η επιλογή του σωστού εξαρτάται από το για το οποίο θέλετε να το χρησιμοποιήσετε. Ξεκινήστε καθορίζοντας ποια είναι η πιο ουσιαστική λειτουργία που θέλετε να διαθέτει το λογισμικό σας. Με αυτόν τον τρόπο μπορείτε εύκολα να εξαλείψετε προγράμματα που δεν ανταποκρίνονται στις ανάγκες σας.

2. Αν ψάχνετε για ελεύθερο λογισμικό, επισκεφτείτε το δωρεάν λογισμικό Molecular biology. Εδώ μπορείτε να βρείτε περισσότερα από 20 δωρεάν προγράμματα. Κάντε κλικ στους συνδέσμους που σχετίζονται με το λογισμικό που θέλετε να δοκιμάσετε. Θα μεταφερθείτε στον ιστότοπο του λογισμικού και από εκεί θα διαβάσετε την περιγραφή. Κατεβάστε και αξιολογήστε όπως θέλετε.

3. Το λογισμικό γενετικής ανάλυσης έχει μια αλφαβητική λίστα με περισσότερα από 480 προγράμματα που δημιουργήθηκαν αρχικά από τον Δρ Wentian Li. Διαβάστε τις περιγραφές ανά λογισμικό για να προσδιορίσετε ποια θέλετε να αξιολογήσετε για τη χρήση σας. Ρίξτε μια ματιά στην ενότητα "τι νέο υπάρχει" για να δείτε τις τελευταίες προσθήκες σε αυτήν την αναπτυσσόμενη λίστα. Υπάρχει μια ενότητα "ξεπερασμένα προγράμματα" που παρέχει πληροφορίες σχετικά με το λογισμικό που είναι "Προγράμματα χωρίς συντήρηση, χωρίς Web ή Συγχωνεύσεις". Ο «σύνδεσμος προς άλλες πηγές» σας φέρνει σε ιστότοπους που διατηρούνται από διάφορες εταιρείες, οργανισμούς, ερευνητικές εγκαταστάσεις και εκπαιδευτικά ιδρύματα που εστιάζουν στη βιοπληροφορική και σε συναφείς τομείς. Ορισμένοι ιστότοποι αναφέρουν το διαφορετικό λογισμικό ακολουθίας γονιδίων που χρησιμοποιούν, ενώ άλλοι παρέχουν δωρεάν λήψεις του λογισμικού τους.

4. Ανατρέξτε στις Αρχές και τις μεθόδους ανάλυσης ακολουθίας που είναι ένα κεφάλαιο στο βιβλίο Ακολουθία - Εξέλιξη - Λειτουργία των Eugene Koonin και Michael Galperin. Αναφέρεται ένας αριθμός αλγορίθμων και εργαλείων λογισμικού που χρησιμοποιούνται στην ταυτοποίηση και τον προσδιορισμό αλληλουχίας γονιδίων.

Κριτικές χρηστών online

5. Δείτε το παρακάτω λογισμικό παρακάτω. Αναζητήστε κριτικές χρηστών στο διαδίκτυο για περισσότερες πληροφορίες σχετικά με το λογισμικό. Οι κριτικές χρηστών μπορούν να είναι εξαιρετικές πηγές πληροφοριών. Δημοσιεύστε τα δικά σας ερωτήματα για να σας βοηθήσουμε να αποφασίσετε σχετικά με το λογισμικό που θα χρησιμοποιήσετε.

• Lasergene - από την DNASTAR, η εταιρεία προσφέρει φιλικά προς το χρήστη εργαλεία λογισμικού για επιστήμονες που επικεντρώνονται στις βιοεπιστήμες. Το Lasergene αποτελείται από 7 εφαρμογές που επικεντρώνονται στην ανάλυση αλληλουχίας DNA και πρωτεϊνών. Μπορείτε να το δοκιμάσετε δωρεάν.
• Το Sequencher 4,10.1 - κατασκευάζεται από το Genecodes.com είναι ένα λογισμικό συναρμολόγησης και ανάλυσης ακολουθιών DNA. Υπερηφανεύεται ότι όχι μόνο είναι εύκολο στη χρήση αλλά και γρήγορα. Κατεβάστε το δοκιμαστικό αντίγραφο για την αξιολόγησή σας.

6. Το Ευρωπαϊκό Ινστιτούτο Βιοπληροφορικής (EBI) παρέχει δωρεάν υπηρεσίες δεδομένων και βιοπληροφορικής στην επιστημονική κοινότητα. Παρέχουν πληροφορίες σχετικά με την τεχνολογία αιχμής που χρησιμοποιείται στη βιοπληροφορική. Στην ενότητα "Εργαλεία" μπορείτε να βρείτε συνδέσμους προς τα διάφορα εργαλεία δομικής ανάλυσης που χρησιμοποιούνται στο EBI.

Προγράμματα ανάλυσης ακολουθίας γονιδίων

7. Εάν δεν έχετε βρει ακόμα το σωστό λογισμικό, χρησιμοποιήστε τη μηχανή αναζήτησης του προγράμματος περιήγησής σας για να βρείτε άλλα προγράμματα ανάλυσης ακολουθίας γονιδίων. Δοκιμάστε να χρησιμοποιήσετε πολλές μηχανές αναζήτησης, ώστε να μην περιορίζεστε σε αυτές που βρίσκονται μόνο από μία μηχανή αναζήτησης.

Η ανάλυση ακολουθίας γονιδίων χρησιμοποιεί λογισμικό που χρησιμοποιεί μεθόδους στη βιοπληροφορική προκειμένου να προσδιορίσει τη δομή και τη βιολογική λειτουργία των γονιδίων καθώς και τις πρωτεΐνες που σχετίζονται με αυτά. Το Διαδίκτυο μπορεί να σας βοηθήσει να βρείτε το καλύτερο λογισμικό ανάλυσης ακολουθιών γονιδίων. Επωφεληθείτε από δωρεάν λογισμικό ή δωρεάν δοκιμές για να μάθετε ποιο λογισμικό είναι πιο χρήσιμο για εσάς.